Characterization of the cellular location of the gene product of orf19.1549 in Candida albicans
dc.contributor.advisor | Álvarez Botas, Francisco Javier | |
dc.contributor.author | Quishpe Usca, Angélica Naomi | |
dc.date.accessioned | 2025-08-15T13:42:43Z | |
dc.date.issued | 2025-08 | |
dc.description | Candida albicans is a common human fungal pathogen whose virulence relies on its ability to adapt to different environments through processes like hyphal formation, stress response, and membrane remodeling. These processes involve membrane-associated proteins, many of which are organized within microdomains rich in sterols and sphingolipids known as lipid rafts. While proteomic studies have identified numerous membrane-associated proteins, many remain uncharacterized, limiting our understanding of the pathogen’s biology. One such protein is the product of orf19.1549, previously detected in detergent-resistant membrane fractions but with unknown localization and function. This study aimed to investigate its cellular localization by tagging it with a codon-optimized red fluorescent protein (yEmRFP) using the SAT1 flipper system. A tagging construct was assembled by gap repair cloning in Saccharomyces cerevisiae, combining gene flanking regions with the yEmRFP-SAT1 flipper cassette in plasmid pJA37. After recovery, the construct was transformed into C. albicans, and heterozygous mutants were selected upon marker excision (pop-out). Fluorescence microscopy confirmed the expression of the fluorescent marker in live cells; however, the absence of a consistent subcellular fluorescence pattern made conclusions about the protein’s localization inconclusive. Although the system enables tagging, further optimization is needed to confirm correct integration and expression of a functional protein. Overall, this study demonstrates the application of the SAT1 flipper system for gene tagging in addition to its conventional use in gene deletion, providing a simple molecular tool for studying uncharacterized genes in C. albicans. | |
dc.description.abstract | Candida albicans es un patógeno fúngico humano cuya virulencia depende de su capacidad para adaptarse a diversos entornos mediante procesos como la formación de hifas, la respuesta al estrés y la remodelación de membranas. Estos procesos involucran proteínas asociadas a membranas, muchas organizadas en microdominios ricos en esteroles y esfingol lípidos conocidos como balsas lipídicas. Aunque estudios proteómicos han identificado muchas de estas proteínas, gran parte permanece sin caracterizar, lo que limita nuestra comprensión de su biología. Una de ellas es el producto del orf19.1549, previamente detectado en estos microdominios, pero cuya localización y función se desconocen. Nuestro objetivo fue investigar su localización celular mediante la fusión con una proteína fluorescente roja (yEmRFP), utilizando el sistema SAT1 flipper. Para ello, se ensambló un constructo de marcaje por clonación mediante gap repair en S. cerevisiae, combinando las regiones flanqueantes del gen con la cassette yEmRFP-SAT1 en el plásmido pJA37. Tras su recuperación, el constructo fue transformado en C. albicans, y se seleccionaron mutantes heterocigotos luego de la escisión del marcador. La microscopía de fluorescencia confirmó la expresión del marcador fluorescente en algunas células vivas; sin embargo, la ausencia de un patrón de fluorescencia consistente impidió obtener conclusiones definitivas sobre la localización. Si bien el sistema permitió el etiquetado, es necesario optimizarlo para confirmar una integración precisa y la expresión de una proteína funcional. En general, este estudio demuestra la utilidad del sistema SAT1 flipper para el marcaje génico, ampliando su uso más allá de la deleción y proporcionando una herramienta accesible para estudiar genes no caracterizados en C. albicans. | |
dc.description.degree | Ingeniero/a Biomédico/a | |
dc.identifier.uri | https://repositorio.yachaytech.edu.ec/handle/123456789/979 | |
dc.language.iso | en_US | |
dc.pagination.pages | 88 páginas | |
dc.publisher | Universidad de Investigación de Tecnología Experimental Yachay | |
dc.rights | openAccess | |
dc.subject | Marcaje génico | |
dc.subject | Balsas lipídicas | |
dc.subject | Gap repair | |
dc.subject | Gene tagging | |
dc.subject | Lipid rafts | |
dc.title | Characterization of the cellular location of the gene product of orf19.1549 in Candida albicans | |
dc.type | bachelorThesis |