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http://repositorio.yachaytech.edu.ec/handle/123456789/303
Full metadata record
DC Field | Value | Language |
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dc.contributor.advisor | Tellkamp Tietz, Markus Patricio | - |
dc.contributor.author | Santiago Padilla, Leandro Manuel | - |
dc.date.accessioned | 2021-04-09T16:05:33Z | - |
dc.date.available | 2021-04-09T16:05:33Z | - |
dc.date.issued | 2021-03 | - |
dc.identifier.uri | http://repositorio.yachaytech.edu.ec/handle/123456789/303 | - |
dc.description | Lassa fever is an acute multisystemic viral disease characterized by high mortality. This disease is caused by the Lassa virus (LASV), belonging to the order of the Bunyavirales. The World Health Organization classifies it as one of the eight priority diseases for research and development. Structural studies of the proteins involved in the infectious cycle of different viruses have opened a new world of therapeutic opportunities. Among these, new broad-spectrum antiviral strategies have been developed. Members of the Bunyavirales taxonomic order are characterized by a segmented single-stranded RNA genome with negative or ambisense polarity. Each segment is encapsulated by multiple nucleoproteins (NP) and bound to an RNA-dependent RNA polymerase (RdRp), also known as L-protein. So far, an endonuclease domain has been discovered in the N-terminal region of several bunyaviral L-proteins involved in viral genome transcription. In this study, we optimized the purification conditions of the LASV L protein endonuclease domain for its later use in structural studies. The purification was performed using a two-step approach, an affinity chromatography followed by a final size exclusion. Two tags were compared for affinity chromatography, an MBP and a GST -tag, with the latter showing the most promising results. To optimize the purification, a thermal stability assay was carried out. It was determined that the best solvent conditions for purification are HEPES buffer at pH 7.5, 1 M NaCl, and 5 mM MnSO4. A final pure sample was obtained with a 3.9 mg/ml concentration. | es |
dc.description.abstract | La fiebre de Lassa es una enfermedad vírica multisistémica aguda caracterizada por una alta mortalidad. Esta enfermedad es causada por el virus Lassa (LASV), perteneciente al orden de los Bunyavirales y está catalogada por la Organización Mundial de la Salud como una de las ocho enfermedades prioritarias para la investigación y el desarrollo. Los estudios estructurales de las proteínas que participan en el ciclo infeccioso de diferentes virus, han abierto un nuevo mundo de oportunidades terapéuticas. Entre estas, nuevas estrategias antivirales de amplio espectro. Los miembros del orden taxonómico Bunyavirales se caracterizan por presentar genomas segmentados de una sola hebra de ARN con polaridad negativa o ambisentido. Cada segmento está encapsulado por múltiples nucleoproteínas (NP) y unido a una ARN polimerasa dependiente de ARN (RdRp), también conocida como proteína L. Hasta ahora, se ha descubierto un dominio de endonucleasa en la región N-terminal de varias proteínas L de Bunyavirales que participan en la transcripción del genoma viral. En este estudio se optimizó las condiciones de purificación del dominio endonuclease de la proteína L de LASV para su posterior uso en estudios estructurales. La purificación se realizó usando un enfoque de dos pasos, una cromatografía de afinidad seguida de una exclusión molecular. Se compararon dos marcadores diferentes para la cromatografía de afinidad, un marcador MBP y uno GST, mostrando el último los resultados más prometedores. Con el fin de optimizar la purificación, se realizó un proceso de ensayo de estabilidad térmica y se determinó que las mejores condiciones de solvente para la purificación es tampón HEPES a pH 7,5 una concentración de sal de NaCl 1 M y MnSO4 5 mM. Se obtuvo una muestra final pura con una concentración de 3,9 mg/ml. | es |
dc.language.iso | eng | es |
dc.publisher | Universidad de Investigación de Tecnología Experimental Yachay | es |
dc.rights | openAccess | es |
dc.subject | Bunyavirales | es |
dc.subject | Cap-snatching | es |
dc.subject | Fiebre de Lassa | es |
dc.subject | Lassa virus | es |
dc.subject | Cromatografía de afinidad | es |
dc.subject | Exclusión de tamaño | es |
dc.subject | Ensayo de estabilidad térmica | es |
dc.subject | Lassa fever | es |
dc.subject | Affinity chromatography | es |
dc.subject | Size exclusion | es |
dc.subject | Thermal stability assay | es |
dc.title | Expression and purification of Lassa virus cap-snatching endonuclease | es |
dc.type | bachelorThesis | es |
dc.description.degree | Biólogo/a | es |
dc.pagination.pages | 69 páginas | es |
Appears in Collections: | Biología |
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