Please use this identifier to cite or link to this item:
http://repositorio.yachaytech.edu.ec/handle/123456789/336
Title: | Automatic high-resolution ananlysis of pap test cells |
Authors: | Chang Tortolero, Oscar Guillermo Toapanta Maila, Bryan Oswaldo |
Keywords: | Redes neuronales Papanicolaou Células Cáncer de cuello uterino Neural network Pap smear Cell Cervix cancer Screen |
Issue Date: | May-2021 |
Publisher: | Universidad de Investigación de Tecnología Experimental Yachay |
Abstract: | Según la Organización Mundial de la Salud (OMS), el cuarto tipo de cáncer más frecuente en mujeres es el de cuello uterino. En Ecuador en 2018, hubo 1612 casos de esta enfermedad y 838 muertes. Una práctica vital para evitar estas pérdidas es el diagnóstico temprano de la enfermedad, que se logra con la prueba de Papanicolaou. Una de las labores del médico o técnico patólogo es revisar la muestra de Papanicolaou y determinar si el paciente tiene células cancerosas sospechosas o evidentes. En Ecuador, el médico revisa el frotis de Papanicolaou “manualmente”, es decir, tiene que revisar la imagen del microscopio digital del frotis poco a poco hasta cubrir toda la imagen; esta búsqueda puede llevar hasta 30 minutos para un operador experimentado. En 2014, había menos de 389 patólogos en Ecuador, lo que muestra una falta de personal y, en consecuencia, una dificultad importante para el diagnóstico temprano. Esta tesis utiliza redes neuronales convolucionales en el ambiente de TensorFlow para crear un sistema de escaneo rápido para el reconocimiento de células. El método propuesto emplea un proceso de dos etapas. La primera etapa es un escaneo de alta velocidad de baja resolución que detecta las células, las amplía y luego pasa una versión de alta resolución a la siguiente etapa. La segunda etapa se encarga de la clasificación de alta resolución. La máquina se creó utilizando un conjunto de 963 imágenes de frotis de Papanicolaou de base líquida. Estas imágenes corresponden a 460 pacientes y fueron tomadas con un aumento de 40x utilizando un microscopio Leica ICC50 HD. El software ya entrenado clasifica las células en normales y anormales para que luego, un patólogo altamente capacitado pueda revisar las muestras sospechosas de Papanicolaou haciendo un análisis de cerca, ayudando a los patólogos a lograr un diagnóstico más temprano y mejorando el servicio médico. |
Description: | According to the World Health Organization (WHO), the fourth most frequent cancer in women is cervix cancer. Specifically for Ecuador in 2018, there were 1612 cases of this disease and 838 deaths. A vital practice to avoid these losses is an early diagnosis of the disease, accomplished by the Papanicolaou or Pap test. One of the doctor or technician pathologists' labors is to check the so-called pap smear and determine if the corresponding patient has suspicious or evident cancer cells. In Ecuador, the doctor checks pap smear “manually,” that is, they have to check the digital microscope picture of the smear little by little until the whole picture is covered; this search may take up to 30 minutes for an experienced operator. By 2014, there were less than 389 pathologists in Ecuador, showing a lack of personnel and, in consequence, a severe difficulty for early diagnosis. This thesis uses convolutional neural networks in the TensorFlow ambient to create a fast scanning abnormal cell recognition system. The proposed method employs a two-stage process. The first stage is a low-resolution high-speed scanning that detects cells, zooms into them, and then passes a high-resolution version to the next stage. The second stage is in charge of the high-resolution classification. The software was created using a set of 963 liquid-based pap smear images. These images corresponded to 460 patients and were taken with a 40x magnification using a Leica ICC50 HD microscope. The trained system classifies cells into normal and abnormal so that later, a highly trained pathologist can review suspicious pap smear samples doing a close-up analysis, helping pathologists achieve earlier diagnosis and improving medical service. |
URI: | http://repositorio.yachaytech.edu.ec/handle/123456789/336 |
Appears in Collections: | Tecnologías de la Información |
Files in This Item:
File | Description | Size | Format | |
---|---|---|---|---|
ECMC0056.pdf | 18.21 MB | Adobe PDF | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.