Molecular docking of IgY against Salmonella spp. as potential vaccine for veterinary use

Abstract

El presente trabajo utiliza técnicas de acoplamiento molecular para analizar la interacción entre la subestructura FimH de Salmonella Typhimurium y los anticuerpos IgY, buscando identificar posibles epítopos viables par. Se evaluaron diferentes modelos de IgY y fragmentos de FimH mediante simulaciones de acoplamiento molecular, logrando identificar una región de unión prometedora entre una parte de la cadena B de IgY y un fragmento de FimH. Si bien los valores de energía de unión no alcanzaron inicialmente el rango ideal, la optimización de parámetros permitió mejorar la afinidad de unión a niveles cercanos a los requeridos para pruebas in vitro según estándares de la FDA. Este modelo de interacción FimH-IgY sirve como punto de partida para investigaciones futuras enfocadas en mejorar aún más la afinidad de unión, con el fin último de desarrollar una vacuna efectiva contra Salmonella spp. en aves. Los resultados resaltan el potencial de la tecnología de anticuerpos IgY y las simulaciones de acoplamiento molecular para el diseño racional de vacunas. Se requieren más estudios para confirmar y refinar este modelo preliminar de epítopo vacunal antes de pruebas in vitro. En conclusión, este trabajo sentó las bases para el desarrollo de una alternativa prometedora para controlar infecciones por Salmonella spp. en la industria avícola.