Molecular docking as a tool to search vaccine candidates against Salmonella targeting poultry

Abstract

La Salmonella es una bacteria gramnegativa conocida por ser la causante de enfermedades gastrointestinales en animales y humanos. Una parte determinante de la patogenicidad de Salmonella es la unión bacteriana a las células o estructuras del huésped, que está mediada por la fimbria de esta, más específicamente por FimH. Determinar dónde se produce la interacción entre la FimH de Salmonella y el huésped, en este caso el TLR4 del pollo podría ser decisivo para su control y mitigación de esta bacteria. El objetivo de este estudio es encontrar interacciones que sirvan como posibles epítopos para el desarrollo de una vacuna contra la Salmonella. Para ello se realizó un estudio in silico de la estructura. El acoplamiento molecular se realizó en Autodock Vina, el cual generó una serie de tablas con los diez mejores modelos de cada simulación. Como resultado, se determinó que siete de estos modelos podrían usarse como candidatos para el desarrollo de vacunas, antes de pasar a las pruebas experimentales es necesario realizar un análisis más detallado de estos modelos.