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http://repositorio.yachaytech.edu.ec/handle/123456789/802| Title: | Ru Complex Compound interaction with Amyloid-β Fibrils for structure destabilization as a therapeutic approach for Alzheimer’s Disease |
| Authors: | Terencio, Thibault Saucedo Vázquez, Juan Pablo López Acosta, Alfredo Fernando |
| Keywords: | Acoplamiento molecular Dinámica molecular Complejo metálico de rutenio Molecular docking Molecular dynamics Ruthenium metal complex |
| Issue Date: | Jun-2024 |
| Publisher: | Universidad de Investigación de Tecnología Experimental Yachay |
| Abstract: | La enfermedad de Alzheimer (EA) es una de las enfermedades neurodegenerativas más comunes con efectos impactantes en personas mayores de 60 años. La principal seña de identidad de la EA es el péptido beta amiloide 42 (Aβ42), cuya no eliminación desencadena varios efectos negativos en el cerebro humano. Aβ42 ha sido comúnmente seleccionado como objetivo principal de degradación e inhibición fibrilar. Moléculas orgánicas y organometálicas han sido ampliamente estudiados por sus efectos desestabilizadores sobre Aβ42. Curiosamente, los complejos de rutenio han mostrado resultados positivos en la desestabilización de las fibrillas de Aβ42 siendo considerados como una alternativa prometedora para el diseño de fármacos. Por tanto, todo este proyecto revisa patrones especiales de interacción entre moléculas orgánicas ya estudiadas y complejos de rutenio sobre la fibrilla Aβ42. Se discute la química subyacente a estas interacciones proporcionando un conjunto de directrices que pueden orientar a los científicos sobre el tipo de grupos funcionales, residuos importantes de interacción y características del rutenio para un diseño de fármacos sencillo. A partir de las directrices mencionadas, se propusieron 6 complejos de rutenio que presentan características químicas importantes. Sus correspondientes capacidades de desestabilización se prueban y comparan mediante herramientas computacionales que emplean técnicas de acoplamiento molecular y dinámica molecular a través de 3,5 ns de simulación. Aquí se muestran las diferencias de cada propuesta y se destaca la molécula más prometedora profundizando en las interacciones no covalentes de los complejos basados en rutenio sobre el oligómero Aβ42. |
| Description: | Alzheimer’s disease (AD) is one of the most common neurodegenerative diseases with impactful effects on people above 60 years old. AD main hallmark is represented by the amyloid beta 42 (Aβ42) peptide whose non-clearance unchains several negative effects in the human brain. Aβ42 has commonly been selected as the main target for its fibrillar degradation and inhibition. Organic and organometallic molecules have been extensively studied by their destabilizing effects over Aβ42. Intriguingly, ruthenium complexes have shown positive results in destabilizing Aβ42 fibrils being stared as a promising alternative for drug design. Thus, this whole project reviews special patterns of interaction between already studied organic molecules and ruthenium complexes over the Aβ42 fibril. The chemistry beneath these interactions is discussed providing a set of guidelines that can orient scientists on the type of functional groups, important residues of interaction, and ruthenium features for a straightforward drug design. From the mentioned guideline, 6 ruthenium complexes were proposed showcasing important chemical features. Their corresponding destabilization capabilities are tested and compared through computational tools employing molecular docking and molecular dynamics techniques through 3.5 ns of simulation. Differences from each proposal and the highlight of the most promising molecule is shown here delving on the non-covalent interactions of ruthenium-based complexes over the Aβ42 oligomer. |
| URI: | http://repositorio.yachaytech.edu.ec/handle/123456789/802 |
| Appears in Collections: | Química |
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