Unraveling the phylogenomics, phylogeography, and demographic history of Ralstonia solanacearum phylotype II that infects Musa spp. across America

Abstract

Ralstonia solanacearum filotipo II (Rs-pII) es el agente causante de la marchitez bacteriana en especies de Musa (por ejemplo, plátano y banano), comúnmente conocida como Moko. Esta bacteria fitopatógena provoca las consecuencias más devastadoras en los cultivos de plátano y banano en todo el continente americano, generando preocupaciones globales sobre su impacto en la seguridad alimentaria. La investigación genómica sobre Rs-pII es escasa. Una clara comprensión de la dinámica evolutiva de Rs-pII, causante de la enfermedad de Moko, es crucial para adoptar estratégicamente las medidas de prevención y control biológico más eficaces pero asequibles para salvaguardar la seguridad alimentaria a nivel mundial. En este estudio, se realizó una reconstrucción filogenómica, historia demográfica, e inferencia filogeográfica a partir de datos genómicos para descifrar la dinámica evolutiva de Rs-pII causante de la enfermedad de Moko. Las secuencias genómicas fueron descargadas desde la base de datos NCBI. La base de datos genómica comprende cepas de Rs-pII que infectan especies de Musa, muestreadas entre 1959 y 2015 en diversas ubicaciones geográficas de América. El árbol filogenético, la demografía histórica y la dinámica espacial de la bacteria fitopatógena se estimaron utilizando el software BEAST y programas relacionados. Los resultados confirman la clasificación de las cepas de Rs-pII en filotipos IIA y IIB. La historia demográfica de Rs-pII causante de la enfermedad de Moko se describe como constante durante el período histórico estudiado. Las epidemias de Rs-pII están ampliamente distribuidas en América, particularmente en América del Sur, a través de una compleja red de rutas de diseminación. En consecuencia, Brasil y Colombia destacan como puntos críticos clave para la propagación de las epidemias de la enfermedad de Moko. Adicionalmente, se encontró respaldo filogenómico y filogeográfico que sustenta el origen brasileño de las cepas de Rs-pII.