Fishing potent tyrosinase inhibitors with new molecular docking protocol from natural products ocean

Velastegui Gamboa, Camila Lissett

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DC Field	Value	Language
dc.contributor.advisor	Santiago Vispo, Nelson Francisco	-
dc.contributor.author	Velastegui Gamboa, Camila Lissett	-
dc.date.accessioned	2021-06-10T11:49:58Z	-
dc.date.available	2021-06-10T11:49:58Z	-
dc.date.issued	2021-06	-
dc.identifier.uri	http://repositorio.yachaytech.edu.ec/handle/123456789/326	-
dc.description	Melanin has an important biological role, although their overproduction and accumulation are associated with some diseases going from skin problems as melasma to Parkinson's disease. The overproduction of melanin is due to an increase in the number of melanocytes or melanogenic enzyme activity. The melanocytes are regulated mainly by the tyrosinase enzyme, which catalyzes the two most important steps to produce pigments. This makes the oxidoreductase the principal target to inhibit melanin production. Currently, there are some tyrosinase inhibitors (TIs) used for the treatment of various skin disorders. Nevertheless, the current TIs had associated some safety problems such as their high cytotoxicity, mutagenesis, non-lasting effects, among others. Therefore, the need for new, more effective, broad-spectrum, safer, and longer-lasting protection of TIs is clear. The existing "in vitro" methods to find new inhibitors are expensive and with limited efficacy. The present study will focus on developing a theoretical study with a molecular docking protocol that uses a diverse panel of tyrosinases for the first time and allows the discovery of new TIs using an expert system. Here, we developed classification models with machine learning techniques based on the tyrosinase panel's molecular docking. We developed and integrated all this workflow into free available software SiLis PREENZA for the prediction of TIs. Furthermore, we made an update of the known tyrosinase inhibitors of 701 to 2514 reported so far. This report will help enhance the process of finding tyrosinase inhibitors to seek novel depigmenting agents for the treatment of hyperpigmentation disorders. The compounds identified as inhibitors could be used to narrow "in vitro" experimentations first with phenotypic experiments until they reach melanoma cells.	es
dc.description.abstract	La melanina tiene un rol biológico importante, aunque su sobreproducción y acumulación están asociadas a algunas enfermedades que van desde problemas cutáneos como el melasma hasta la enfermedad de Parkinson. La sobreproducción de melanina se debe a un aumento del número de melanocitos o de la actividad de las enzimas melanogénicas. Los melanocitos están regulados principalmente por la enzima tirosinasa que cataliza los dos pasos más importantes para la producción de pigmentos. Esto hace que la oxidorreductasa sea el principal objetivo para inhibir la producción de melanina. Actualmente, existen algunos inhibidores de la tirosinasa (TI) que se utilizan para el tratamiento de diversos trastornos de la piel. Sin embargo, los TI actuales estan asociados a algunos problemas por su alta citotoxicidad, mutagénesis, efectos no duraderos, entre otros. Por lo tanto, es clara la necesidad de Tis nuevos, más eficaces, de amplio espectro, más segura y más duradera efecto. Los métodos "in vitro" existentes para encontrar nuevos inhibidores son costosos y de eficacia limitada. El presente estudio se enfocará en desarrollar un estudio teórico con un protocolo de acoplamiento molecular que utiliza por primera vez un panel diverso de tirosinasas y permite el descubrimiento de nuevos TI utilizando un sistema experto. Aquí, desarrollamos modelos de clasificación con técnicas de aprendizaje automático basados en variables de panel de acoplamiento molecular de tirosinasa. Desarrollamos e integramos todo este flujo de trabajo en el software gratuito disponible SiLis- PREENZA para la predicción de TI. Además, hicimos una actualización de los inhibidores de tirosinasa conocidos de 701 a 2514 reportados hasta ahora. Este informe será útil para mejorar el proceso de búsqueda de inhibidores de tirosinasa para buscar nuevos agentes despigmentantes para el tratamiento de trastornos de hiperpigmentación. Los compuestos identificados como inhibidores podrían usarse para limitar los experimentos "in vitro" primero con experimentos fenotípicos hasta llegar a las células del melanoma.	es
dc.language.iso	eng	es
dc.publisher	Universidad de Investigación de Tecnología Experimental Yachay	es
dc.rights	openAccess	es
dc.subject	Inhibidor de tirosinas	es
dc.subject	Acoplamiento molecular	es
dc.subject	Autodock-Vina	es
dc.subject	Modelos predictivos	es
dc.subject	SiLis-PREENZA Software	es
dc.subject	Cribado virtual	es
dc.subject	Productos naturales	es
dc.subject	Tyrosinase inhibitor	es
dc.subject	Molecular docking	es
dc.subject	Machine learning	es
dc.subject	Predictive model	es
dc.subject	Virtual screening	es
dc.subject	Natural product	es
dc.title	Fishing potent tyrosinase inhibitors with new molecular docking protocol from natural products ocean	es
dc.type	bachelorThesis	es
dc.description.degree	Biólogo/a	es
dc.pagination.pages	65 páginas	es
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