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http://repositorio.yachaytech.edu.ec/handle/123456789/343
Full metadata record
DC Field | Value | Language |
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dc.contributor.advisor | Tellkamp Tietz, Markus Patricio | - |
dc.contributor.author | Pulgar Sánchez, Mary Estefanía | - |
dc.date.accessioned | 2021-06-22T16:31:51Z | - |
dc.date.available | 2021-06-22T16:31:51Z | - |
dc.date.issued | 2021-06 | - |
dc.identifier.uri | http://repositorio.yachaytech.edu.ec/handle/123456789/343 | - |
dc.description | Disease vector insects rely on chemosensors to locate hosts, find mates and choose where to lay their eggs. Currently, the most efficient method of preventing and controlling the outbreak of insect-borne diseases has been the use of insect repellents (IRs). However, they do not meet the necessary conditions, such as protecting a broad spectrum of mosquitoes; many of them have unpleasant odors or produce unpleasant sensations on the skin, some of them are even carcinogens. In other words, current IRs have significant drawbacks. Therefore, the need for new, more effective, safer, and longer-lasting broad-spectrum IRs than conventional IRs is evident. Here, classifiers for predicting IRs will be developed by using QuBiLS Suite 0-3D molecular descriptors and shallow machine learning techniques. The best individual models were used to obtain ensemble models with suitable statistical parameters for the learning series. In the present work, we intend to introduce, for the first time, the ability of QSAR- (Quantitative Structure-Activity Relationships) and structure-based models to describe the interaction of IRs with the olfactory response of the sensilla of the mosquito Culex quinquefasciatus as well as with repellent activities by using four datasets that take into consideration the two most relevant IR scaffolds: carboxamides and plant-derived compounds with repellent effect on A. aegypti (and also A. gambiae) and the two most common species of cockroach (Blattella germanica and Periplaneta americana). A non-commercial and cross-platform software named “SiliS-PAPACS” was developed for the IRs-prediction and is freely available at http://tomocomd.com/apps. This software will be used for the screening of datasets containing diverse chemotypes like essential oils constituents, chemicals, and FDA-approved drugs. The purpose is to assess the usefulness of the developed models in the IR-labeling of organic substances and show the system's ability to identify novel IR leads (new IR chemical Scaffold). Here, we report 23 novel compounds found through virtual screening that may have potential repellent activity. The results suggest that the proposed method will be an excellent computer-assisted system that could increase the chance of finding new insect control agents and assist those researchers in screening and/or designing new chemotype IRs. | es |
dc.description.abstract | Los insectos vectores de enfermedades dependen quimiorreceptores para localizar a los huéspedes, encontrar parejas y elegir dónde poner sus huevos. Actualmente, el método más eficaz para prevenir y controlar el brote de enfermedades transmitidas por insectos ha sido el uso de repelentes de insectos (RIs). Sin embargo, no cumplen con las condiciones necesarias como para brindar protección ante un amplio espectro de mosquitos; muchos de ellos tienen olor o sensaciones en la piel desagradable, incluso algunos de ellos son cancerígenos; es decir, los RI actuales tienen importantes inconvenientes. Por lo tanto, es evidente la necesidad de nuevos RI de protección de amplio espectro, más efectivos, seguros y duraderos que los RI convencionales. Aquí, los clasificadores para la predicción de RI se desarrollarán mediante el uso de descriptores moleculares QuBiLS Suite 0-3D y técnicas de aprendizaje automático superficial. Los mejores modelos individuales se usaron para obtener modelos conjuntos con parámetros estadísticos adecuados para la serie de aprendizaje. En el presente trabajo pretendemos introducir, por primera vez, la capacidad de QSAR- (Relaciones cuantitativas estructura-actividad) y modelos basados en estructura para describir la interacción de los RI con la respuesta olfativa de la sensilla del mosquito Culex quinquefasciatus, así como con actividades repelentes mediante el uso de cuatro conjuntos de datos que tomaron en consideración los dos andamios de RI más relevantes: carboxamidas y compuestos derivados de plantas con efecto repelente sobre A. aegypti (y también A. gambiae) y las dos especies más comunes de cucarachas ( Blattella germanica y Periplaneta americana). Se realiza un software no comercial y multiplataforma, denominado “SiliS-PAPACS”, para la predicción de RI, que está disponible gratuitamente en http://tomocomd.com/apps. Este software se utilizará para el cribado de conjuntos de datos que contienen diversos quimiotipos como componentes de aceites esenciales, productos químicos y medicamentos aprobados por la FDA. El propósito es evaluar la utilidad de los modelos desarrollados en el etiquetado IR de sustancias orgánicas y mostrar la capacidad del sistema para identificar nuevos andamios químicos. Aquí presentamos 23 compuestos nuevos encontrados a través de cribado virtual que pueden tener potencial actividad repelente. Los resultados sugieren que el método propuesto será un buen sistema asistido por computadora que podría aumentar potencialmente la posibilidad de encontrar nuevos agentes para el control de insectos. Es decir, este estudio proporciona información importante que ayudará a los que evalúan y/o diseñan nuevos quimiotipos de RIs. | es |
dc.language.iso | eng | es |
dc.publisher | Universidad de Investigación de Tecnología Experimental Yachay | es |
dc.rights | openAccess | es |
dc.subject | Repelente de insectos | es |
dc.subject | Proteína de unión a odorantes | es |
dc.subject | Software SiliS-PAPACS | es |
dc.subject | Índices algebraicos 0-3D | es |
dc.subject | Aprendizaje automático | es |
dc.subject | Insect repellent | es |
dc.subject | Odorant binding protein | es |
dc.subject | Machine learning | es |
dc.subject | Docking | es |
dc.subject | Atom- and Bond-based 0-3D algebraic indices | es |
dc.title | Prediction models for the discovery of insect repellents that interfere with olfaction | es |
dc.type | bachelorThesis | es |
dc.description.degree | Biólogo/a | es |
dc.pagination.pages | 91 páginas | es |
Appears in Collections: | Biología |
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