Virtual screening of antiangiogenic cancer treatment peptides based on network science and a similarity searching based approach

Abstract

Los tratamientos convencionales contra el cáncer, como la quimioterapia o los fármacos quimioterapéuticos, presentan limitaciones debido a su toxicidad, resistencia y baja especificidad. La investigación actual se centra en terapias alternativas, destacando la importancia del soporte vascular en el crecimiento tumoral. El objetivo es inhibir la angiogénesis tumoral, explorando moléculas antiangiogénicas como péptidos y proteínas, que ofrecen ventajas sobre los fármacos convencionales. Debido a la escasez de fármacos antiangiogénicos, la investigación propuesta pretende examinar las secuencias de péptidos antiangiogénicos (AAP) notificadas mediante un enfoque novedoso que se basa en la ciencia de redes y la minería de datos. Para abordar este trabajo, se construyeron redes de metadatos (MENTs) cuyo análisis permite profundizar en el análisis, proporcionando una mejor comprensión de las características biológicas, los patrones y las relaciones generales entre las AAPs. Además, se examinó el espacio químico de los PAA mediante redes espaciales proximales (HSPNs) utilizando seis medidas de disimilitud bidireccionales, y el examen del efecto del punto de corte (t). A continuación, para garantizar la diversidad y evitar la sobrerrepresentación de las redes, se realizó una extracción de andamiajes que dio lugar a 96 subconjuntos. Este proceso ayudó a limitar el trabajo al análisis de tres métricas y a considerar para cada una sólo t = 0,00. Por último, se descubrieron y enriquecieron 37 motivos antiangiogénicos potenciales, lo que proporcionó información valiosa para el futuro desarrollo de fármacos más eficaces y selectivos, minimizando los efectos secundarios y mejorando la eficiencia de los tratamientos contra el cáncer.