Analysis of the similarity of DNA sequence of the gene of a translesion polymerase in trypanosomatids

Abstract

Las especies de tripanosomátidos son de especial interés debido a sus implicaciones en la salud pública, la ciencia veterinaria y la economía. Dichos parásitos son responsables de diversas enfermedades tales como la enfermedad de chagas, tripanosomiasis africana y leishmaniasis que afectan a los humanos. Así como la enfermedad denominada como nagana, la cual infecta principalmente al ganado. A pesar de su asociación, con enfermedades en animales y humanos se conoce poco sobre la función de varias moléculas presentes en los distintos parásitos, lo que dificulta la comprensión de su biología. Entre estos se encuentra la polimerasa θ, la cual se hipotetiza que está involucrada en procesos de síntesis translesion del ADN, proceso que permite superar lesiones del ADN, como se ha demostrado en otros organismos eucariotas. En este estudio, presentamos un enfoque in silico para analizar el genoma de la polimerasa θ en seis especies de tripanosomátidos y lo comparamos con sus homólogos en H. sapiens y A. thaliana. Adicionalmente, comparamos con organismos procariotas, como E. coli y B. subtilis, sugiriendo su posible rol en procesos de reparación del ADN. Además, investigamos interacciones proteína-proteína en tres sistemas de polimerasas: TbPolθ-TbPolσ, TcPolθ-TcPolσ y LmPolθ-LmPolσ. Nuestros hallazgos revelaron fuertes energías libres de enlace de −14.34, −8.01 y −8.97 kcal/mol, respectivamente. Se identificaron interacciones clave que forman puentes salinos, lo que sugiere posibles roles estructurales y regulatorios de estos complejos proteicos. Estos resultados sugieren que Polθ podría desempeñar un papel en mecanismos de reparación del ADN, además de participar en procesos de mantenimiento de cromosomas, reforzando su relevancia dentro de la biología de los tripanosomátidos.